Un aperçu des défis informatiques et bioinformatiques de l’axe analyse structurale et métabolomique 

Léa Cabioch (BioGenouest)
Thursday, November 8, 2018 - 10:30
Room Aurigny
Talk abstract: 

L’axe analyse structurale et métabolomique s’intéresse à la caractérisation de structures de composés chimiques et au profilage non ciblé de composés présents dans des matrices naturelles ou transformées, dans le domaine des sciences de la vie. Trois plates-formes composent cet axe : BIBS centrée sur les activités de caractérisation structurale de biopolymères à différentes échelles et par différentes modalités ; PHENOTIC centrée sur le phénotypage d’objets végétaux par la bio-imagerie ; Corsaire, plate-forme multi-sites, spécialisée dans l’analyse de petites molécules par des approches ciblées et non ciblées dans les échantillons biologiques. L’activité des trois plates-formes fait appel à des méthodes variées pour l’acquisition, le traitement et la gestion des données. Bien que les données soient acquises en quantité et en qualité plus élevées, leur stockage/gestion ne semble pas poser de difficultés. En revanche, le traitement des données générées en grand nombre et leur intégration/fusion lorsqu’elles sont de natures différentes restent un frein conséquent au travail des chercheurs. Cette difficulté est d’autant plus présente lorsqu’un effort d’harmonisation avec différents laboratoires est mis en place, voire avec la communauté planétaire.